消化内科包括消化病区、消化内镜中心、消化专科门诊、炎症性肠病门诊，是惠州市临床重点专科、国家级上消化出血救治快速通道5星建设单位、国家消化道早癌防治中心联盟、广东省胃镜早癌精查联盟单位、幽门螺旋杆菌规范化诊治门诊市级示范中心、惠州市大肠癌筛查基地，拥有专业的医护团队共44人，其中高级职称7人，中级职称15人，学科带头人徐显林院长是惠州市名医。

消化内科病房占地面积1700平方米，设置病床共40张。消化内镜中心占地面积达2200平方米，设立8个操作间，按照国际标准建造。拥有5套目前最先进的奥林巴斯290系列电子胃肠镜和十二指肠镜，小儿胃镜，爱尔博电刀，高端内窥镜清洗消毒等专科设备，医疗配置达三甲医院水平。

心血管内科是惠州市胸痛中心联盟副主席单位，2017年在惠阳地区首家通过中国胸痛中心基层版认证，2020年通过中国胸痛中心标准版认证。心血管内科对心绞痛、心肌梗死、心衰、高血压、心脏瓣膜病、心律失常(心动过速、心动过缓、早搏、心房纤颤等)、心肌病、肾动脉狭窄等各种心血管疾病提供从筛查到治疗一体化服务，是本地区唯一有进口支架选择的医院，并独立设置CCU病房和导管室。

神经外科包含神经重症监护区与普通病区，是收治脑肿瘤、脑血管疾病（颅内动脉瘤、动静脉畸形、脑出血、脑梗塞)、脊髓疾病、颅脑损伤、癫痫等神经系统疾病的专科。

三和医院呼吸与危重症医学科于2020年通过国家PCCM科规范化建设三级医院达标单位认证。

医院普外科是惠阳区重点专科、惠州市临床重点专科培育发展项目、中华结直肠癌MDT联盟成员单位、中国医师协会外科医师分会疝和腹壁外科专委会主委陈双教授工作站。